L'UMR AMAP est une unité interdisciplinaire qui travaille à l'acquisition de connaissances fondamentales sur les plantes et les végétations dans le but de prévoir la réponse des écosystèmes aux forçages environnementaux, en termes de distribution/conservation des espèces et de la biodiversité, production des cultures agronomiques, stockage du carbone dans la biomasse végétale, protection de l'environnement et des services écosystèmiques. Ces travaux s'intéressent aux végétations méditerranéennes, tempérées et tropicales. Ils croisent les champs disciplinaires de la botanique (systématique et structurale), l'écologie de la végétation, l'agronomie et la foresterie avec ceux de l'informatique, des mathématiques et statistiques appliquées. Les recherches de l'unité s'articulent autour de 3 axes transversaux, la plupart des chercheurs de l'unité contribuant à plusieurs axes :
• Biodiversité : systématique, biogéographie, écologie
• Biomasse : dynamique et production des plantes et des peuplements
• Plantes numériques : modèles, analyses et données de l'organe aux écosystèmes
L'unité porte également la responsabilité scientifique des herbiers IRD de Cayenne et Nouméa et pilote l'infrastructure de botanique participative, Pl@ntNet. Elle héberge également plusieurs plateformes logicielles (Capsis, AMAP-Studio, Forest-RS).