Le thème central et fédérateur de l’unité est l’évolution et son corollaire la biodiversité. La démarche est pluridisciplinaire, relevant de la génomique, de la génétique, de l’écologie, du comportement et de la physiologie, et est menée à différents niveaux d’intégration, du génome à l’espèce et parfois à la communauté. Différents aspects de l’évolution sont déclinés par les pôles : adaptation, spéciation, interactions génome-environnement ou encore interactions entre espèces au sein d’un écosystème. Ces mots clefs sont retrouvés comme axes transversaux dans les activités des différents pôles du laboratoire. L’objectif général du pôle Evolution et Ecologie, qui rassemble les personnels IRD de l'UMR, est de comprendre et prédire les réponses d’insectes tropicaux aux changements globaux, et se décline en trois axes : identifier les mécanismes évolutifs et écologiques impliqués dans ces réponses, évaluer l’impact de ces changements sur la diversité des insectes nuisibles ou auxiliaires et de leur interaction, élaborer in fine, selon différents scénarios socio-écologiques, des modèles décrivant l’effet des changements globaux sur la structure et la dynamique des communautés, des populations et des gènes, pour la prédiction d’impacts agronomiques ou de santé publique dans les régions tropicales. Pour cela le pôle rassemble des domaines d’expertise complémentaires (étho-physiologie, génétique et génomique des populations, systématique, phylogéographie, écologie des communautés) lui permettant de mettre en œuvre des développements nouveaux dans les champs émergeant de l’écophylogénétique, la génomique de l’adaptation locale, la modélisation démo-génétique en dynamique des populations. Plusieurs programmes du pôle Ecologie sont inscrits dans une démarche sociétale de durabilité par le développement de méthodes agro-écologiques de protection et production des cultures, par des actions de conservation de la biodiversité et en analysant l'impact de l'urbanisation sur l'évolution des vecteurs de maladies tropicales.