Objectifs scientifiques et projet de recherche

La trypanosomose animale africaine (TAA) se traduit par des pertes directes et indirectes entraînant la mortalité, la baisse de productivité, l’importation de viandes, de produits laitiers et de trypanocides qui aggravent le déficit de la balance commerciale. Les pertes annuelles ainsi dues à la TAA sont estimées à plusieurs milliards de dollars. De plus, près de 35 millions de doses de trypanocides, pour un coût de plus de 30 millions de dollars, sont annuellement administrées pour contrôler la TAA. Dans de nombreux pays, la résistance aux trypanocides a été signalée. Cependant, l’étendue et l’importance de cette résistance restent méconnues et très sous-estimées. Quoique les 30 millions de dollars dépensés pour l’achat des trypanocides soient importantes pour l’économie paysanne, cette somme reste néanmoins très insuffisante pour justifier le développement de nouveaux trypanocides. Le contrôle de la TAA s'appuiera toujours sur les trypanocides actuels. A côté de la chimiorésistance, les variations des profils cliniques et pathologiques observées chez les animaux trypanosomés restent aussi mal connues. Comprendre la diversité phénotypique observée chez les hôtes et appréhender les bases génétiques et moléculaires du développement de la chimiorésistance nécessitent des investigations génomiques et transcriptomiques comparatives entre isolats de trypanosomes responsables de différents phénotypes cliniques et variant dans leur résistance/sensibilité aux trypanocides. Ce projet vise donc à améliorer nos connaissances épidémiologiques sur la TAA en identifiant et isolant des trypanosomes résistants et sensibles aux trypanocides. Ces parasites seront caractérisés sur le plan génomique et transcriptomique pour comprendre les bases génétiques et moléculaires de la chimiorésistance et de la variabilité phénotypique, et aussi identifier des marqueurs de la résistance et de la pathogénicité. Différents types de résistance seront évalués et cartographiés en vue du développement de stratégies de gestion rationnelle des trypanocides.

Unités IRD impliquées

2R17700 : INTERTRYP

Institutions membres

Université de Dschang : Université de Dschang

Responsable(s)

M. x

Correspondant

Mme. X

Disciplines scientifiques

Sciences de la Terre et de l'univers, espace

Thématiques de recherche

Pour cette étude, du sang sera prélevé chez des animaux domestiques de quatre régions du Cameroun, afin de réaliser le diagnostic parasitologique puis de procéder à l’identification moléculaire des trypanosomes présents à partir de l’ADN extrait de ce sang. Les types de résistance aux trypanocides seront ensuite identifiés à l’aide d’outils moléculaires permettant de produire des cartes de distribution des infections trypanosomiennes et des types de résistance. Chez les animaux infectés, du sang sera re-prélevé et inoculé chez des souris pour l’isolement des trypanosomes. Des tests de sensibilité in vivo permettront d’isoler des souches sensibles et résistantes, ainsi que celles responsables de différents phénotypes cliniques. L’administration de sous doses curatives de trypanocides chez des souris infectées par des trypanosomes sensibles permettra de générer des isolats isogéniques. L’ADN et l’ARN seront extraits de ces différents types d’isolat/souches pour les analyses génomiques et transcriptomiques comparatives. Cette étude actualisera nos connaissances sur la prévalence des trypanosomes et les types de résistance aux trypanocides. La carte de distribution spatiale des trypanosomes et des types de résistance aidera au développement de stratégies de gestion rationnelle des trypanocides. La liste des SNPs codants et non codants générée par les analyses génétiques et transcriptomiques permettra de comprendre les bases génétiques et moléculaires du développement de la résistance et des différences phénotypiques. Les analyses transcriptomiques permettront d’identifier des gènes potentiellement impliqués dans la résistance et l'apparition de différents phénotypes cliniques. Les données générées à partir des isolats isogéniques permettront de comprendre les bases épigénétiques du développement de la résistance et ouvriront des pistes de recherches visant à surmonter la chimiorésistance.